O trabalho da CQI no Ruanda começou em 2004 com o programa global do Coffee Corps, uma subvenção directa da USAID para desenvolver o Coffee Corps. Os líderes do projecto PEARL (Partnership for Enhancing Agriculture through Linkages in Rwanda), também financiado pela USAID, contactaram a CQI para que os voluntários complementassem o seu programa de copos. O projecto PEARL e o subsequente projecto SPREAD foram muito bem sucedidos, resultando numa completa transformação da indústria do café ruandesa.
De 2005 a 2006, houve mais de 20 voluntários enviados para o Ruanda, principalmente formadores de copos, mas também baristas e especialistas de mercado. Estes voluntários eram da mais alta qualidade e, sem eles, o sucesso do projecto PEARL não teria sido o mesmo. No início, um voluntário reconheceu que a senhora da limpeza, Claire, estava interessada no curso e decidiu incluí-la, embora os locais não estivessem satisfeitos com isso. Ela mostrou as suas capacidades e dedicação durante o curso e é agora uma das líderes da indústria do café ruandesa.
De 2007 a 2012, a maior parte do financiamento para o CQI no Ruanda veio do projecto regional da USAID com Steve Walls. Este foi uma continuação do trabalho anterior e o CQI tinha uma parceria no país (ICP) com o OCIR. O OCIR já não existe, e o sector do café está sob a égide do NAEB (National Agricultural Export Development Board), que trata de todos os produtos agrícolas. A CQI assinou acordos de ICP com a NAEB, mas parte do impulso inicial diminuiu principalmente devido à falta de financiamento. No entanto, ainda existem niveladores Q activos e alguma actividade através do sector privado. O CQI também tem estado envolvido na investigação sobre o problema do "gosto da batata" que prevalece no Ruanda e no Burundi.
Há mais de uma década que compradores especializados têm vindo a destacar os cafés ruandeses e o café ruandês de alta qualidade pode ser visto globalmente.
Desde 2020, a CQI tem sido um parceiro-chave no projecto Ruanda Ikawa Nziza Cyane (INC), financiado pela UE, implementado pela TechnoServe. Com o objectivo de criar valor partilhado para os produtores, empresas, financiadores e reguladores de café, reforçando a competitividade do Ruanda em cafés especiais, a CQI juntou-se ao projecto para fornecer educação pós-colheita de processamento de café aos produtores, processadores e estudantes através dos Cursos de Processamento de Qualidade da CQI.
Ao longo da vida do programa, o CQI ministrou Cursos Profissionais de Processamento Q de Nível 2 a gestores e exportadores de estações de lavagem de café (CWS), Cursos Generalistas de Processamento Q de Nível 1 a jovens, bem como forneceu contributos e orientação para o desenvolvimento de um conjunto de normas mínimas de qualidade para as CWS no Ruanda.
Ao longo deste projecto, o CQI ministrou um total de sete (7) cursos de Processamento Q de Nível 1 e cinco (5) cursos de Processamento Q de Nível 2, com um total de 247 participantes nos cursos (incluindo repetições). Todos os cursos de Processamento Q deste projecto foram ministrados pelo instrutor de Processamento Q, Ephrem Sebatigita.