O Peru é o líder mundial no comércio justo e nos cafés orgânicos e é fundamental para o fornecimento de arábica lavada. A CQI começou a trabalhar no Peru através do programa Coffee Corps financiado pela USAID em 2003. Após este projecto inicial, em 2006 a CQI começou a trabalhar com vários doadores internacionais, bem como outro projecto da USAID com ACDI/VOCA.
A CQI associou-se a um grupo cooperativo, Cafe Peru (Central Café y Cacao), que construiu um centro de formação para fazer cursos de Q e anteriormente funcionou como CQI's In Country Partner. A CQI tem trabalhado extensivamente no Peru em todos os aspectos da produção, processamento, baristas, cupping, concursos, marketing, e desenvolvimento de associações. A maioria das primeiras tarefas concentraram-se na assistência a competições e formação em campeonatos nacionais. Os sectores estão algo fragmentados, com grandes diferenças entre as organizações cooperativas e os grandes comerciantes internacionais. Além disso, não há apoio do governo central.
Em 2013, a CQI com ACDI/VOCA e parceiros locais, organizou um workshop de 3 dias com toda a indústria e governo que fez bons progressos. A maior parte do financiamento dos doadores para o Peru veio da eliminação do comércio da droga (cocaína) e da replantação de outras culturas de rendimento como o café, o cacau, e outras.
Há uma série de novas oportunidades pendentes para o CQI com parceiros governamentais locais (Promperú e INACAL) e financiamento da UNIDO. O Peru também está activo com o programa Q e tem hoje 66 Q graders.