Quando a CQI começou a trabalhar nas Honduras, era um produtor de mercadorias e estava mesmo a vender café abaixo do mercado C. Em 2006, durante o programa CADR, a CQI desempenhou um papel vital na melhoria do sector do café hondurenho. Após um esforço considerável, reuniões com exportadores, formação em cupping e assistência de marketing, vários exportadores envolveram-se na selecção de lotes especiais e utilizaram o cupping como ferramenta.
As Honduras têm um clima ideal, belas montanhas, e muitas vezes têm regiões muito remotas, fazendo da perificabilidade um factor. A CQI e outras organizações internacionais trabalharam nas Honduras para melhorar a qualidade a todos os níveis. As Honduras tornaram-se agora um dos fornecedores mais consistentes de cafés especiais. Hoje em dia, mais de 30% do seu café é especialidade e o preço médio está bem acima do mercado C.
Para o programa Q, de 2009-2010, o CQI recebeu uma bolsa do grupo holandês SNV para aumentar o número de Q graders e, através desta, também expulsou um instrutor Q, Rolando Canas, que está activo a nível mundial em nome do CQI, tanto como instrutor Q como formador a nível de produtor. O Parceiro Nacional das Honduras costumava ser exclusivamente a Associação de Exportadores, mas agora partilha esta responsabilidade com a organização nacional IHCAFE, que dispõe de uma instalação de formação de alto nível. Rolando permitiu às Honduras manterem-se actualizadas com o programa Q, mas as Honduras poderiam ainda beneficiar de assistência técnica adicional. Tal como muitos países da América Central, a ferrugem do café tem sido um problema grave nos últimos anos.
