A CQI começou a trabalhar no Burundi em 2009, colaborando com o programa da USAID para a Expansão da Competitividade e do Comércio na África Oriental (COMPETE) para expandir o Sistema Q Coffee, colaborar e apoiar a Associação Africana dos Cafés Finos (AFCA) e desenvolver estratégias competitivas para o café Fine Robusta. O objectivo partilhado entre estas organizações é proporcionar a todos os países produtores de café da África Oriental a oportunidade de maximizar a sua eficácia no mercado e atribuir prémios a toda a cadeia de valor do café.
De 2008 a 2012, como parte deste programa, a CQI forneceu formação e assistência técnica no Burundi, Etiópia, Quénia, Malawi, Tanzânia, e Uganda. Uma ênfase regional reuniu 13 pessoas altamente qualificadas do Quénia, Uganda, Tanzânia, e Ruanda para o primeiro curso Q Grader Train-the-Trainer da África Oriental. Todos os alunos completaram o curso com sucesso e são agora Instrutores Q Assistentes. Ted Lingle, antigo director executivo do CQI e instrutor Q, comentou: "Estes indivíduos são os copos 'nata da colheita', e possuem tanto as capacidades de copos como de ensino para se tornarem excelentes instrutores de copos".
Em 2016 estimava-se que das cerca de 35.000 TM de café, a especialidade estava nos 2%, mas isto poderia aumentar para 50% ao longo do tempo se estes programas continuassem a ser implementados. De facto, o Burundi beneficiará rapidamente devido à actual infra-estrutura da estação de lavagem e ao ambiente de produção de qualidade. A expedição e o transporte são questões importantes no Burundi sem litoral, pelo que são necessárias formações para os exportadores sobre gestão e logística do transporte, incluindo o estabelecimento de prazos realistas de entrega, para gerir as expectativas e restrições.
Com base no trabalho com a COMPETE, a CQI trabalhou com a INTERCAFE (a associação local da indústria do café) e a ARFIC (a agência reguladora do café do governo local). Esta última foi apoiada num projecto financiado pela UNIDO (Organização das Nações Unidas para o Desenvolvimento Industrial), para o qual a CQI fez uma avaliação laboratorial e um seminário sobre café de qualidade para as partes interessadas em 2016.
O Coffee Quality Institute, em parceria com a Organização das Nações Unidas para o Desenvolvimento Industrial (UNIDO), associou-se ao Programa de Capacitação Comercial no Burundi em 2018 para oferecer formação de provadores de café a um grupo seleccionado de profissionais de garantia de qualidade. Este programa, financiado pelo Banco Mundial, visava melhorar o desempenho das exportações do Burundi, facilitar o acesso dos produtos aos mercados internacionais e regionais, e assegurar o cumprimento dos regulamentos sanitários e fitossanitários.
